Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A1P02462 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms