Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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LTAP01374 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTAP01374 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTAP01374 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTAP01374 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LTAP01374 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTAP01374 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTAP01374 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTAP01374 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTAP01374 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTAP01374 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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LTAP01374 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTAP01374 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTAP01374 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTAP01374 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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LTAP01374 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTAP01374 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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LTAP01374 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTAP01374 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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LTAP01374 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTAP01374 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTAP01374 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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LTAP01374 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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LTAP01374 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTAP01374 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTAP01374 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTAP01374 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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LTAP01374 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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LTAP01374 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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