Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUDT3O95989 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms