Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1O95476 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms