Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms