Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG12O94817 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG12O94817 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG12O94817 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG12O94817 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG12O94817 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG12O94817 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG12O94817 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG12O94817 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms