Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCATO75600 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCATO75600 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GCATO75600 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCATO75600 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCATO75600 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCATO75600 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCATO75600 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCATO75600 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCATO75600 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCATO75600 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GCATO75600 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCATO75600 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCATO75600 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCATO75600 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCATO75600 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCATO75600 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCATO75600 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCATO75600 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCATO75600 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCATO75600 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCATO75600 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCATO75600 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCATO75600 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCATO75600 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCATO75600 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCATO75600 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCATO75600 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms