Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGR5O75473 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGR5O75473 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR5O75473 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR5O75473 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR5O75473 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR5O75473 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR5O75473 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR5O75473 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR5O75473 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR5O75473 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR5O75473 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR5O75473 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR5O75473 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR5O75473 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR5O75473 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR5O75473 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR5O75473 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR5O75473 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR5O75473 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR5O75473 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR5O75473 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR5O75473 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR5O75473 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR5O75473 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR5O75473 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR5O75473 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR5O75473 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR5O75473 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR5O75473 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LGR5O75473 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms