Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP1O75113 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms