Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPINK4O60575 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms