Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3APO60318 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms