Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms