Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms