Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KCNAB3O43448 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms