Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA3O43365 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms