Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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HOXC11O43248 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC11O43248 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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HOXC11O43248 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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HOXC11O43248 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC11O43248 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC11O43248 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC11O43248 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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