Protein–RNA interactions for Protein: O15145

ARPC3, Actin-related protein 2/3 complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC3O15145 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC3O15145 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms