Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SLF1-207ENST00000508130 1079 ntTSL 25.09□□□□□ -1.596e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.697e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.696e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.76e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ZFYVE16-207ENST00000510995 2873 ntTSL 1 (best)4.33□□□□□ -1.727e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.827e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.96e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.926e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -26e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.016e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TCP1-217ENST00000546023 1135 ntTSL 1 (best)26.1■■□□□ 1.774e-71■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TCP1-214ENST00000543532 561 ntTSL 424.77■■□□□ 1.564e-71■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.454e-71■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TCP1-209ENST00000538128 557 ntTSL 423.53■■□□□ 1.364e-71■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TCP1-208ENST00000537390 691 ntTSL 521.05■□□□□ 0.964e-71■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.214e-71■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.435e-11■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.613e-16■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TOR3A-205ENST00000472001 656 ntTSL 317.46■□□□□ 0.392e-13■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.013e-16■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.083e-16■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 EGR2-206ENST00000639815 1075 ntTSL 513.1□□□□□ -0.313e-16■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TMEM45B-203ENST00000525709 247 ntTSL 55.49□□□□□ -1.534e-29■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NBR1-207ENST00000592304 964 ntTSL 215.09■□□□□ 0.015e-13■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.265e-13■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.365e-13■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NBR1-206ENST00000590996 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.555e-13■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.045e-13■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NBR1-204ENST00000586650 586 ntTSL 1 (best)4.22□□□□□ -1.735e-13■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TJP1-210ENST00000558447 720 ntTSL 327.07■■□□□ 1.922e-18■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.952e-18■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.332e-18■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-18■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 TJP1-206ENST00000473741 270 ntTSL 23.59□□□□□ -1.832e-18■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 TOLLIP-204ENST00000527085 595 ntTSL 522.69■■□□□ 1.221e-13■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.383e-14■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 BACH1-213ENST00000550131 349 ntTSL 24.52□□□□□ -1.693e-14■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 BACH1-211ENST00000548219 325 ntTSL 24.52□□□□□ -1.693e-14■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 BACH1-209ENST00000546469 485 ntTSL 34.52□□□□□ -1.693e-14■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 BACH1-210ENST00000547141 315 ntTSL 24.52□□□□□ -1.693e-14■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 RETREG2-208ENST00000458520 992 ntTSL 312.35□□□□□ -0.431e-13■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.528e-9■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 AC008575.2-203ENST00000512790 1850 ntTSL 218.08■□□□□ 0.498e-9■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.238e-9■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.118e-9■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 AC008575.2-201ENST00000503445 506 ntTSL 313.29□□□□□ -0.288e-9■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.298e-9■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 AC008575.2-202ENST00000506997 1643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.428e-9■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 SRP19-207ENST00000515755 631 ntTSL 212.01□□□□□ -0.498e-9■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 SRP19-204ENST00000505459 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.758e-9■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.228e-9■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 SDF4-204ENST00000459994 604 ntTSL 516.32■□□□□ 0.26e-16■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 SQSTM1-215ENST00000514093 842 ntTSL 519.87■□□□□ 0.776e-16■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 35.6
DDX3XO00571 FAM107B-212ENST00000471815 899 ntTSL 211.9□□□□□ -0.57e-12■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM107B-224ENST00000491458 425 ntTSL 37.02□□□□□ -1.297e-12■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 05e-9■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.055e-9■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.125e-9■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 ANAPC5-210ENST00000536416 677 ntTSL 317.31■□□□□ 0.366e-37■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.266e-37■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 ANAPC5-211ENST00000536837 509 ntTSL 416.13■□□□□ 0.176e-37■■■■■ 35.5
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DDX3XO00571 ANAPC5-216ENST00000539871 704 ntTSL 512.96□□□□□ -0.336e-37■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 ANAPC5-218ENST00000541887 2400 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.016e-37■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.72e-9■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.582e-9■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)21.13■□□□□ 0.977e-44■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.527e-44■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 C11orf24-207ENST00000532534 687 ntTSL 320.42■□□□□ 0.865e-11■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 C11orf24-203ENST00000529339 603 ntTSL 217.37■□□□□ 0.375e-11■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 C11orf24-208ENST00000532969 485 ntTSL 215.65■□□□□ 0.15e-11■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM57A-203ENST00000570699 2386 ntTSL 220.8■□□□□ 0.921e-13■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 PAFAH1B3-208ENST00000601865 646 ntTSL 220.02■□□□□ 0.89e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.59e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.069e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 PAFAH1B3-205ENST00000596265 465 ntTSL 313.99□□□□□ -0.179e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 PAFAH1B3-204ENST00000595530 582 ntTSL 212.76□□□□□ -0.379e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 PAFAH1B3-207ENST00000599778 380 ntTSL 512.05□□□□□ -0.489e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 RCN2-204ENST00000557805 691 ntTSL 320.64■□□□□ 0.896e-57■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.892e-17■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 ETV4-206ENST00000585508 760 ntTSL 519.69■□□□□ 0.742e-17■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.572e-17■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 ETV4-207ENST00000586764 581 ntTSL 315.92■□□□□ 0.142e-17■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 ATG9A-222ENST00000488833 487 ntTSL 218.44■□□□□ 0.541e-14■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.274e-32■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.792e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-217ENST00000520254 579 ntTSL 419.67■□□□□ 0.742e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-208ENST00000518344 554 ntTSL 319.22■□□□□ 0.672e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-221ENST00000522361 367 ntTSL 419.04■□□□□ 0.642e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-219ENST00000521223 587 ntTSL 418.62■□□□□ 0.572e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-209ENST00000518879 820 ntTSL 518.46■□□□□ 0.552e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.482e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.442e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-205ENST00000518167 421 ntTSL 517.74■□□□□ 0.432e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.392e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-216ENST00000520204 699 ntTSL 516.92■□□□□ 0.32e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-211ENST00000519070 561 ntTSL 316.76■□□□□ 0.272e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.262e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-210ENST00000519020 573 ntTSL 516.29■□□□□ 0.22e-15■■■■■ 35.5
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