Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H7C1D1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C1D1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C1D1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C1D1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C1D1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H7C1D1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H7C1D1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H7C1D1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H7C1D1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H7C1D1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H7C1D1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H7C1D1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
H7C1D1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C1D1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms