Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms