Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1LA6NFU8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms