Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms