Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms