Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PIPSLA2A3N6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIPSLA2A3N6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms