Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLRN2A0PK11 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms