Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms