Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 TESK2-201ENST00000372084 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 RGPD2-201ENST00000398146 6931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 SLC24A1-201ENST00000261892 5768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 BNIPL-201ENST00000295294 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LONP2-201ENST00000285737 8199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 GNG8-201ENST00000300873 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 CFTRP3-201ENST00000376400 212 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 SPAG11B-205ENST00000398462 655 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 TPT1P4-201ENST00000403538 519 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LINC02068-202ENST00000424941 563 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC012506.2-201ENST00000426527 533 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 FTLP4-201ENST00000430740 493 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 RFC4-207ENST00000433496 1111 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ADGRF5P1-201ENST00000435875 1135 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LLPHP2-201ENST00000436405 396 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 IFNWP18-201ENST00000437472 591 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AL357079.1-202ENST00000445226 294 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 IFNWP9-201ENST00000448683 591 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LINC02561-201ENST00000449457 692 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC010973.1-201ENST00000479085 511 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 THAP6-211ENST00000507885 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 GJA1P1-201ENST00000511478 1143 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 GAPDHP70-201ENST00000515281 1045 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC114781.2-201ENST00000515670 394 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 IGHV3-50-201ENST00000522107 317 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 COX7B2-204ENST00000543208 587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 TRBV7-1-201ENST00000547918 380 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LRP1-AS-202ENST00000555461 645 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 FLVCR2-213ENST00000556856 1020 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 TUBBP8-201ENST00000560273 1232 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC027277.2-201ENST00000566325 435 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 RN7SL493P-201ENST00000580401 299 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 IGHV1OR15-6-201ENST00000603166 343 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 RPS20-212ENST00000618656 627 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC024257.4-201ENST00000618746 458 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC100827.4-201ENST00000563464 2441 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 NCAM1-201ENST00000316851 5837 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 KPNA3-201ENST00000261667 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ARHGAP19-203ENST00000371027 2301 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 KDM2B-206ENST00000538046 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LINC00870-202ENST00000473713 2693 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 TRIM52-205ENST00000611618 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 TARID-209ENST00000630119 4294 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 MLF1-202ENST00000359117 2222 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 TTC5-201ENST00000258821 4779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 YTHDC2-201ENST00000161863 6316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AJUBA-203ENST00000397388 2648 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 TBC1D15-217ENST00000550746 6184 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ZNF83-211ENST00000597597 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 CACNA1E-205ENST00000367570 9724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 SP100-202ENST00000340126 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC090197.1-202ENST00000519692 4374 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 GSPT1-201ENST00000420576 1603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 SPTAN1-201ENST00000358161 7794 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 NTRK3-220ENST00000626019 2741 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 OR4B1-201ENST00000309562 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 IFT122-202ENST00000347300 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 BPNT1-202ENST00000354807 1152 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 OR8B4-201ENST00000356130 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 MIR671-201ENST00000390183 118 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 UBB-202ENST00000395837 1014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 MRPS18BP1-201ENST00000414228 192 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 TIA1-204ENST00000416149 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AL022313.2-201ENST00000442579 372 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 PRDX2P4-201ENST00000447134 600 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 MTND4P30-201ENST00000450281 899 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 EPN2-AS1-201ENST00000451099 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 PAICSP6-201ENST00000462572 1280 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 RN7SL209P-201ENST00000488309 276 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC120036.4-201ENST00000521874 256 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 OR7E4P-201ENST00000530317 1013 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 FGF12-AS1-202ENST00000530635 555 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC010768.2-201ENST00000532524 567 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC112694.1-201ENST00000541939 570 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC068305.3-201ENST00000547590 555 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LINC02304-201ENST00000554445 445 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LINC01852-202ENST00000559232 533 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC009108.2-201ENST00000566485 269 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC005324.1-203ENST00000580194 541 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC004080.4-201ENST00000602610 633 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC105133.2-201ENST00000624158 461 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 DSTYK-201ENST00000367161 7739 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC009227.1-201ENST00000434635 2362 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 CUL9-202ENST00000372647 7684 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ZNF608-201ENST00000306315 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 NEDD4L-203ENST00000357895 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ANKRD45-201ENST00000333279 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 KCNB1-201ENST00000371741 11879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 UNC5D-205ENST00000449677 2448 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 NCEH1-205ENST00000538775 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ZNF548-202ENST00000366197 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 PDE11A-201ENST00000286063 9275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 NPIPB6-202ENST00000533640 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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