Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 FAM197Y9-203ENST00000505707 345 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 IGKV2-14-201ENST00000517571 347 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 TATDN3-207ENST00000526641 1073 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ST3GAL3-234ENST00000531993 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RPEP6-201ENST00000546228 626 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MYL6-206ENST00000547408 683 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 KRT18P47-201ENST00000561341 977 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC004706.2-201ENST00000576277 294 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC113189.3-201ENST00000576615 330 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RN7SL15P-201ENST00000582825 301 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL161725.1-212ENST00000585819 745 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.148-201ENST00000614489 291 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 FAM197Y4-201ENST00000616275 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 FAM197Y5-203ENST00000619815 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC092139.3-201ENST00000624764 968 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 USP54-201ENST00000339859 6247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ATP1B2-201ENST00000250111 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CSMD2-AS1-202ENST00000425631 1367 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 DYNC1I1-206ENST00000457059 2393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 PDCD10-208ENST00000473645 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RSPH10B2-202ENST00000403107 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RSPH10B-203ENST00000405415 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL139020.1-203ENST00000556386 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 DCLRE1C-201ENST00000357717 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ZNF613-202ENST00000391794 2225 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 NFYC-213ENST00000447388 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CNEP1R1-206ENST00000565556 1707 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC104394.1-201ENST00000611658 1748 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SLC6A4-201ENST00000261707 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ZNF714-201ENST00000425625 2562 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC239859.1-201ENST00000449715 2594 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ZNF556-201ENST00000307635 6574 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 HCRTR2-201ENST00000370862 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SORBS2-206ENST00000393528 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 PRRC2C-203ENST00000392078 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MTF2-213ENST00000540243 3845 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 EXOSC10-201ENST00000304457 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 PPP4R1L-202ENST00000334187 2746 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 TPP1-215ENST00000533371 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SCNN1B-208ENST00000568923 1852 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SLF2-203ENST00000370271 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SEC16B-204ENST00000464631 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MLLT3-209ENST00000629733 3264 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SULF1-203ENST00000419716 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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LMO3Q8TAP4 CARD8-203ENST00000447740 5210 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ATOX1-201ENST00000313115 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 OR13C8-201ENST00000335040 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RPS21-201ENST00000343986 344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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LMO3Q8TAP4 AC113607.1-201ENST00000427019 589 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 LANCL1-203ENST00000431941 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL049733.1-201ENST00000440178 603 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 LINC01054-201ENST00000446989 514 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SSU72P1-201ENST00000449911 583 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.53-201ENST00000548393 281 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AP001357.2-201ENST00000586758 710 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 UBA52-205ENST00000595683 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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LMO3Q8TAP4 MIR6777-201ENST00000613934 66 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL138689.1-201ENST00000614612 668 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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LMO3Q8TAP4 AC106886.3-201ENST00000621583 547 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC004678.2-201ENST00000623695 1002 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ECD-205ENST00000454759 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 PRMT3-203ENST00000437750 1736 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SLC25A14-215ENST00000612248 1734 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 EEF1A1P8-201ENST00000419025 1388 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RUBCNL-206ENST00000409879 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CLIP1-209ENST00000537178 5229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 IL36RN-202ENST00000393200 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ANTXR2-201ENST00000307333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MAST4-201ENST00000261569 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MR1-201ENST00000282990 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 HLA-DOA-201ENST00000229829 3489 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CHRM2-202ENST00000401861 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 L3MBTL3-203ENST00000368139 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 DCTN2-202ENST00000543672 1321 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 BARD1-213ENST00000619009 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AL132796.2-201ENST00000554025 1851 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 SCYL3-203ENST00000367772 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 TMEM108-211ENST00000515826 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 HPRT1-201ENST00000298556 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 MAN1A2P1-201ENST00000590286 1400 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ZNF682-202ENST00000397162 3164 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 RBBP8-205ENST00000399725 3260 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ELP2-205ENST00000442325 2722 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 NAV2-208ENST00000527559 11171 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 DSG4-201ENST00000308128 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 WDR36-203ENST00000506538 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC008764.10-201ENST00000625135 1830 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 DNASE1-202ENST00000407479 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AGBL3-203ENST00000436302 3533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 GRIA1-208ENST00000518142 2761 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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