Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms