Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LYVE1Q9Y5Y7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LYVE1Q9Y5Y7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms