Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP16Q9Y5T5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms