Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms