Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HES2Q9Y543 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HES2Q9Y543 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HES2Q9Y543 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HES2Q9Y543 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HES2Q9Y543 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HES2Q9Y543 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
HES2Q9Y543 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES2Q9Y543 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms