Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms