Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms