Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms