Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms