Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FZD1Q9UP38 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD1Q9UP38 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms