Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms