Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK5

VANGL2, Vang-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL2Q9ULK5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VANGL2Q9ULK5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VANGL2Q9ULK5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms