Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms