Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP21Q9UK80 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms