Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF2Q9UK05 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF2Q9UK05 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF2Q9UK05 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF2Q9UK05 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF2Q9UK05 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF2Q9UK05 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF2Q9UK05 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF2Q9UK05 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF2Q9UK05 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF2Q9UK05 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GDF2Q9UK05 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GDF2Q9UK05 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDF2Q9UK05 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms