Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDC23Q9UJX2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC23Q9UJX2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms