Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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RABGEF1Q9UJ41 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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RABGEF1Q9UJ41 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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RABGEF1Q9UJ41 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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RABGEF1Q9UJ41 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RABGEF1Q9UJ41 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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RABGEF1Q9UJ41 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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