Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHY1

NRBP1, Nuclear receptor-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRBP1Q9UHY1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRBP1Q9UHY1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRBP1Q9UHY1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms