Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
KDM5BQ9UGL1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms