Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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