Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms