Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms